Исследование проводится в рамках федеральной программы «Приоритет 2030»
Учёные лаборатории молекулярного моделирования и хемоинформатики
химического факультета Университета Лобачевского на созданной математической
модели внешней мембраны туберкулёзной палочки подбирают вещества,
способные пробить оболочку и атаковать сразу несколько белков-мишеней
бактерии туберкулёза. Это позволит в будущем побороть мультирезистентность
заболевания, бактерии которого, по данным специалистов, всё чаще устойчивы к
большинству известных антибиотиков.
Новое исследование описывает неизвестные ранее защитные механизмы
туберкулёзной палочки. Устойчивость микобактерий туберкулёза к антибиотикам
и выживание в ловушке макрофагов – клетках иммунной системы – обусловлены
многослойной оболочкой из миколовых кислот – длинных цепочек атомов
углерода, водорода и кислорода. Когда они сворачиваются в клубок, оболочка
становится рыхлой и более проницаемой, чем более они развёрнуты, тем сильнее
бактерия защищена. Особенно плотной клеточная стенка туберкулёзной палочки
становится в кислой среде.
Модель внешней мембраны туберкулезной палочки
«Описать структуру микобактерий туберкулёза экспериментальными
методами не так просто, поэтому теоретические подходы выходят на первый план.
Сегодня наши вычислительные мощности – на уровне лучших лабораторий в мире.
Они позволили построить модель клеточной стенки, которая насчитывает до 300
тысяч атомов. Мы можем наблюдать поведение бактерии с точностью до 1.5
микросекунд, а молекулярно-динамическое моделирование позволяет подобрать
соединения, способные пробивать защиту бактерий туберкулёза», – сообщил
ведущий научный сотрудник научно-исследовательской лаборатории
молекулярного моделирования и хемоинформатики ННГУ Станислав Игнатов.
Учёные химического факультета Университета Лобачевского уже подобрали
семь белков-мишеней, которые можно атаковать без вреда для человека. Идёт
поиск соединений, способных блокировать сразу несколько из них и тем самым
помешать бактерии защититься от лекарства.
«На модели мы тестируем более 430 тысяч соединений, молекулы
подходящих веществ должны обладать определенной структурой, размером и
растворимостью. Уже удалось найти несколько атакующих агентов, наиболее
перспективные соединения будем тестировать in vitro», – сообщил Станислав
Игнатов.
Партнёром Университета Лобачевского в этом проекте выступает
Лаборатория медицинской химии МГУ им. М.В. Ломоносова. Команда московских
учёных разработала нейросеть, которая анализирует шансы антибиотиков
преодолеть мембрану микобактерии, повышая точность подбора лекарства. Новые
расчёты химиков ННГУ расширяют прогностические возможности искусственного
интеллекта.
Университет Лобачевского
Нет комментариев