Учёные из Федерального научно-клинического центра физико-химической медицины имени академика Ю.М. Лопухина ФМБА России и НМИЦ онкологии имени Н.Н. Блохина выяснили, что для прогноза эффективности иммунотерапии при меланоме недостаточно определять виды бактерий в кишечнике — разные штаммы одного вида могут как способствовать лечению, так и препятствовать ему. Впервые проведено исследование кишечной микробиоты в когорте российских пациентов с меланомой. Результаты опубликованы в журнале Gut Microbes.
В совокупный анализ вошли 490 образцов из семи независимых когорт пациентов из разных стран. Исследователи получили 527 бактериальных геномов — потенциальных маркеров эффективности иммунотерапии. Выяснилось, что 239 геномов связаны с положительным ответом на лечение, а 288 — с отсутствием эффекта. В первую группу вошли полезные бактерии родов Faecalibacterium, Phocaeicola, Bifidobacterium и Gemmiger, участвующие в поддержании здоровья кишечника. У пациентов, не ответивших на терапию, выявлено повышенное количество условно-патогенных бактерий родов Enterobacter и Klebsiella.
Ключевое открытие: у некоторых видов разные штаммы вели себя противоположным образом. Например, одни штаммы Faecalibacterium prausnitzii, которая ранее считалась способствующей лечению, стабильно присутствовали у пациентов с успешной терапией, другие — у людей, которым терапия не помогла. Аналогичный эффект обнаружен и у других распространённых микроорганизмов. Это объясняет противоречия предыдущих исследований, где одна и та же бактерия в одном случае ассоциировалась с успехом, а в другом — с неудачей.
Открытие позволит врачам точнее предсказывать эффективность дорогостоящей иммунотерапии ещё до назначения препаратов, а в перспективе — повышать шансы на успешное лечение, корректируя кишечную микрофлору пациента. Практика показывает, что примерно у половины больных с меланомой иммунопрепараты не дают желаемого эффекта. Теперь учёные предлагают учитывать не просто видовой состав бактерий, а определять их с точностью до штамма — это позволит персонализировать подход к лечению и избежать неоправданных затрат и побочных эффектов у тех, кому терапия не поможет. Исследование поддержано грантом РНФ.
Фото: Первый автор публикации, Александра Строкач. Источник: Ксения Климина / ФГБУ ФНКЦ ФХМ им. Ю.М. Лопухина ФМБА России
