Нам не страшен омикрон? Ученые присмотрелись к новому штамму коронавируса

Очередная волна пандемии с заоблачной статистикой по заболеваемости стремительно распространяется по России. Сегодня уже кажется странным, если у кого-то из знакомых или родственников нет соответствующих «омикрону» симптомов. Но вместе с тем растет и основанная на собственном опыте уверенность, что с новой заразой мы справляемся легче, чем с предыдущими. Так ли это? Медицинские и научные светила разбирались с «омикроном» в ходе очередного онлайн-собрания Научного совета РАН «Науки о жизни», состоявшегося на площадке пресс-центра МИА «Россия сегодня».

Открывая заседание «“Омикрон”: молекулярно-биологические особенности, эпидемиология, перспективы диагностики и терапии», вице-президент РАН, руководитель секции медико-биологических наук ОМН РАН Владимир Чехонин напомнил, что этот штамм имеет целый ряд особенностей, которые в очередной раз актуализируют тему новой коронавирусной инфекции.

«Мы знаем, что «омикрон» более контагиозен, он передается в семь раз быстрее, чем «дельта»», — напомнил Владимир Чехонин.

Заведующий лабораторией биотехнологии ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф.Гамалеи» Минздрава РФ Сергей Альховский проанализировал генетическую изменчивость SARS-CoV-2 и вероятность того, что «омикрон» станет финальной фазой пандемии коронавируса. Но, судя по всему, надежд на это мало.

«Сам «омикрон» тоже начинает эволюцию, распадаясь на сублинии. Это бесконечный процесс, который мы наблюдаем практически в прямом эфире», — сказал ученый.

По скорости изменчивости SARS-CoV-2 вполне сравним с сезонными коронавирусами, которые вызывают обычную простуду. Это около 25 замен генома в год. Мутации возникают практически во всех частях генома с выраженным пиком, соответствующим спайк-белку (он взаимодействует с клеткой и иммунитетом хозяина). И за изменение фенотипа вируса, как правило, отвечают мутации в S-белке. Они связаны с двумя процессами: продолжением адаптации вируса к рецептору человека и ускользанием от действия иммунитета.

По словам Сергея Альховского, с начала пандемии в 2020 году появилось несколько штаммов с измененным фенотипом, увеличением трансмиссивности, тяжести болезни и числа больных. С такими штаммами связано возникновение волн пандемии. На сегодня их пять, включая «омикрон». При этом даже небольшого числа мутаций бывает достаточно, чтобы вирусы поменяли трансмиссивность, антигенные характеристики.

«Штамм «омикрон» — это что-то, чего мы раньше не видели. Он имеет несколько серьезных отличий от предыдущих вариантов. Прежде всего это большое количество мутаций (около 50 по всей длине генома), из которых 15 — в рецептор-связывающем домене. Все это приводит к тому, что антигенные характеристики «омикрона» в значительной степени изменены и этот штамм очень эффективно ускользает от действия моноклональных антител, а нейтрализующая активность вакцин снижается в 7-40 раз. При этом бустерная ревакцинация «Спутником» восстанавливает защиту», — подчеркнул Сергей Альховский.

Директор Санкт-Петербургского научно-исследовательского института эпидемиологии и микробиологии имени Пастера академик Арег Тотолян выступил с сообщением о молекулярной и иммунологической ковид-диагностике в современных условиях. По словам ученого, инфицирование «омикроном» происходит в течение суток, и ПЦР-тесты достаточно быстро с момента заражения показывают положительный результат. «Омикрон» ставит перед учеными много новых задач. Важным являются вопрос о качестве антител, которые вырабатываются в ответ на «омикрон», и то, как эти антитела будут выявляться имеющимися тест-системами. При этом целесообразно проводить широкое тестирование — оно позволяет определить, каким именно штаммом заразился пациент, и выбрать правильную тактику лечения.

Сравнительным свойствам вариантов коронавируса и эволюционному потенциалу SARS-CoV-2 был посвящен доклад заведующего лабораторией бионанотехнологии, микробиологии и вирусологии факультета естественных наук Новосибирского государственного университета члена-корреспондента РАН Сергея Нетесова.

«От регистрации «омикрона» до его стремительного распространения по миру прошли считаные недели, если не дни, то есть он очень быстро стал доминирующим штаммом в целом ряде стран. У «омикрона» все замены расположены около фуринового сайта, что влияет на симптомы заболевания (выделения из носа, кашель, затрудненное дыхание, высокая температура). При этом «омикрон» в основном размножается в верхних дыхательных путях человека и редко затрагивает легкие», — отметил Сергей Нетесов.

Что касается гипотез о происхождении варианта «омикрон», то ученый считает вполне естественным предположение, что штамм возник из-за длительного хронического течения коронавирусной инфекции у ВИЧ-инфицированных пациентов в ЮАР (в стране более 16% населения ВИЧ-положительны).

Сценарий искусственного происхождении «омикрона», по мнению Сергея Нетесова, несостоятельны по крайней мере по двум причинам.

«Если «омикрон» разрабатывался с целью создания живого вакцинного штамма, то было странно так сильно менять структуру РСД-домена и оставить мутацию в фуриновом сайте расщепления, как в варианте «альфа». Да и зачем бы это было делать тайно? Если предположить, что «омикрон» «изготовили» с целью создания еще более патогенного варианта, то что-то уж больно много странных мутаций и не усилен сайт расщепления фурином, как в «дельте»», — заметил ученый.

Что касается эффективности вакцин, то «Спутник V» активен для предотвращения тяжелого течения заболевания в случае «омикрона» примерно на 50-60%, в случае «дельты» — на 80-90%.
По словам Сергея Нетесова, единственный способ существенно снизить число тяжелых случаев и смертность — практически поголовная вакцинация и ревакцинация. Ученый предостерег, что «омикрон» несет в Россию очень большой подъем заболеваемости: до 400 тысяч инфицированных в день.

«Было бы полезно создать вакцины против «омикрона», потому что вирус с нами надолго», — резюмировал ученый.

Эволюционный биолог, профессор Сколтеха, заведующий лабораторией молекулярной эволюции Института проблем передачи информации РАН Георгий Базыкин посвятил свой доклад эпидемиологии «омикрона» на примере Санкт-Петербурга. Ученый рассказал, что в самом начале пандемии был создан консорциум по секвенированию генома коронавируса, который включает большое число организаций. Группа Базыкина в Сколтехе отвечает за биоформатическую обработку данных. Специалисты установили, что до середины декабря прошлого года все исследованные случаи «омикрона» в России были завозными. Изученная учеными вспышка «омикрона» в санкт-петербургском общежитии 16-27 декабря имела единое происхождение, и обнаруженный там вариант вируса относится к линии ВА 1.1 с потенциально повышенной скоростью распространения. По мнению Георгия Базыкина, разнообразие «омикрона» внутри и снаружи России требует дальнейшего тщательного наблюдения и мониторинга.

Светлана БЕЛЯЕВА

Нет комментариев