Трансформация взрывом. Международная конференция по биоинформатике и системной биологии прошла в Новосибирске

Можем ли мы использовать способность акомиса (иглистой мыши) (на снимке) мгновенно останавливать кровотечение и регенерировать кожный покров в медицине катастроф, а программируемую клеточную гибель — для создания препаратов против рака? Столь актуальные вопросы рассматривались на Международной мультиконференции «Биоинформатика регуляции и структуры геномов/системная биология» (BGRS/SB-2024), прошедшей в Новосибирском государственном университете.
Научный руководитель ФИЦ «Институт цитологии и генетики СО РАН» (ИЦиГ СО РАН) академик Николай Колчанов отметил, что настоящим вызовом для упомянутых в названии конференции наук стали постоянно пополняющиеся огромные массивы генетических данных. Информационный взрыв в генетике привел к необходимости трансформировать классические подходы, и здесь не обойтись без искусственного интеллекта.
Ректор НГУ академик Михаил Федорук напомнил, что история биоинформатики и математической биологии началась именно в Новосибирске, основателем этого направления был Алексей Ляпунов.
В 1961 году знаменитый математик прилетел в Академгородок по приглашению академика Сергея Соболева и уже в 1962-м основал кафедру теоретической кибернетики в НГУ. Благодаря Алексею Ляпунову в ИЦиГ и Институте математики Сибирского отделения Академии наук появились школы по математической биологии, затем в Новосибирске начались работы по математическому моделированию в области вирусологии. А сегодня в НГУ сразу на нескольких факультетах ведут интенсивную подготовку специалистов в области математической биологии и биоинформатики.
— Для Сибирского отделения РАН конференция BGRS/SB имеет особое значение. Реализуется ряд проектов масштаба мегасайенс, которые без биоинформационного обеспечения не смогут достичь намеченных целей. В частности, ЦКП «Сибирский кольцевой источник фотонов», где предполагается решение задач фармакологии, структурной биологии, взаимодействия макромолекул с малыми молекулами, и множество других направлений, — отметил директор ФИЦ фундаментальной и трансляционной медицины академик Михаил Воевода.
Главный научный сотрудник ИЦиГ СО РАН, профессор Университета Отто фон Герике (Магдебург, Германия) Инна Лаврик подчеркнула в своем докладе, что эффективное решение для получения лекарственных препаратов от онкозаболеваний — воспользоваться механизмами программируемой клеточной гибели.
— Сибирские биологи — признанные мировые лидеры в этом направлении, ими уже созданы прототипы лекарств для лечения онкологических и нейродегенеративных болезней, — подчеркнула Инна Лаврик в беседе с журналистами. — А продвинуться в разработках помогает биоинформатика — сегодня можно сделать структурную модель любого белка.
Профессор Университета Джунтендо (Токио, Япония) Олег Гусев выступил с докладом «Уникальные биоресурсы в постгеномную эру: применение мультиомиксных технологий для изучения адаптаций животных-экстремофилов», рассказав об упомянутых выше способностях акомиса.
Но одним из главных экстремофилов, по словам О.Гусева, можно считать всем известную курицу: до сих пор неизвестно, как температурный режим останавливает развитие эмбриона, хотя эта технология давно используется в производстве яиц. По просьбе сельхозпроизводителей ученые ИЦиГ СО РАН начали проект по птицеводству.
Геномной селекции кур в нашей стране нет, однако есть другие подходы к повышению яйценоскости и продлению активного возраста несушек — с помощью биодобавок. Успех в исследованиях может принести сельскому хозяйству десятки миллионов рублей.
Как вы уже поняли, отличительной особенностью BGRS/SB-2024 стала мультидисциплинарность. В рамках конференции работали 13 симпозиумов, посвященных геномике, транскриптомике и биоинформатике, системной компьютерной биологии. Кроме того, ученые рассмотрели, как методы биоинформатики можно применять в фармацевтике и медицине, в том числе для изучения когнитивных процессов и моделирования эпидемий.

Ольга Колесова