В центре внимания дальневосточных исследователей находится трепанг Apostichopus japonicus, который является одним из важнейших видов аквакультуры и наиболее востребованным объектом пищевой и фармакологической промышленностей как в странах Азиатско-Тихоокеанского региона, так и в России; высокая ценность этого беспозвоночного привела к увеличению его промысла. Из-за многолетнего бесконтрольного вылова естественные запасы этого вида сократились до опасного минимума.
Подобное падение численности неизбежно ведёт к уменьшению генетического разнообразия, что лишает вид способности адаптироваться к изменяющимся условиям среды, - отмечают учёные Национального научного центра морской биологии им. А.В. Жирмунского (ННЦМБ) ДВО РАН.
В своих последних научных трудах авторы – научный сотрудник Лаборатории генетики ННЦМБ ДВО РАН Виктория Ягодина и научный руководитель Лаборатории Евгения Бондарь – сфокусировались на поиске и валидации оптимальных генетических маркеров, способных сделать мониторинг трепанга быстрым и доступным. В рамках работы, опубликованной в июне этого года в журнале Thalassas, учёные исследовали ядерный маркер ITS-1 у особей из разных участков залива Петра Великого Японского моря. Анализ показал крайне низкое нуклеотидное разнообразие, что научно подтвердило сильный исторический перелов.
Предыдущее исследование учёных с соавторами из этого же цикла работ было посвящено проверке популярного инструмента популяционной генетики — микросателлитных локусов. Обычно такие маркеры считаются нейтральными, то есть не подверженными естественному отбору, однако авторы решили впервые проверить это предположение напрямую, сопоставив данные с полной картой генома трепанга. Результат оказался неожиданным: один из локусов оказался встроен прямо в кодирующую часть гена семейства AF4/FMR2, который у живых организмов отвечает за активацию транскрипции во время теплового стресса. Это открытие доказывает, что данный маркер не является нейтральным, а напрямую отражает адаптацию трепанга к температурным колебаниям воды.
Объединение подобных «адаптивных» и «нейтральных» маркеров в единую тестовую панель в дальнейшем позволит учёным и сотрудникам морских ферм оперативно оценивать, насколько успешно конкретная популяция справляется со стрессовыми изменениями окружающей среды.
Информация, собираемая специалистами-генетиками, необходима как для планирования государственных программ по охране диких популяций дальневосточного трепанга, так и для нужд стремительно развивающихся марикультурных хозяйств, где важно избегать близкородственного скрещивания при искусственном воспроизводстве.
Источник: Минобрнауки России
