Arabidopsis thaliana, часто именуемый резуховидкой Таля, – небольшое цветковое растение, сыгравшее ключевую роль в формировании современного понимания биологии растений. Этот вид, выступая в роли модельного организма в подавляющем большинстве исследований растений за последние полвека, позволил ученым узнать о реакциях растений на свет, о гормональном контроле поведения растений и о причинах различий в корневых системах. Несмотря на популярность Arabidopsis среди исследователей, многие аспекты его жизненного цикла остаются неизученными.
В Институте Солка был создан первый генетический атлас, охватывающий полный жизненный цикл Arabidopsis. Этот атлас, разработанный с применением методов детальной транскриптомики отдельных клеток и пространственной транскриптомики, демонстрирует особенности экспрессии генов в 400 000 клетках на разных этапах развития Arabidopsis, от семени до взрослого растения. Этот общедоступный ресурс станет ценным инструментом для дальнейшего изучения типов растительных клеток, стадий развития и реакций на стрессовые факторы и воздействия окружающей среды.
Результаты исследования послужат стимулом для развития исследований в области биотехнологии растений, сельского хозяйства и наук об окружающей среде.
По словам старшего автора Джозефа Экера, профессора и исследователя Медицинского института Говарда Хьюза, понимание биологии растений значительно продвинулось, однако до недавнего времени существовали технологические ограничения, препятствовавшие всесторонней каталогизации типов клеток и экспрессируемых ими генов на всех стадиях развития. Новое исследование устраняет эту проблему, предоставляя базовый набор данных по экспрессии генов для большинства типов клеток, тканей и органов на протяжении всего жизненного цикла Arabidopsis.
Итоги работы опубликованы в журнале Nature Plants.
Изображение: Stefan.lefnaer, Wikimedia commons,CC BY-SA 4.0
