Ученые выявили дополнительную версию омикрон-штамма коронавируса, который несет многие из тех мутаций, что и оригинал. Однако он не имеет одной ключевой генетической особенности, сообщает The Guardian . Эта особенность позволяет стандартным ПЦР-тестам отличать новые случаи омикрона от дельта или других вариантов, поэтому новую версию омикрона может быть труднее обнаружить.
Специалисты предложили разделить линию omicron, известную как B.1.1.529, на две подлинии: BA.1 для версии омикрона, которая была первоначально идентифицирована, и B.2 для новооткрытой версии. Разделение было предложено и реализовано в течение последних нескольких дней в Cov-Lineages — онлайн-системе, используемой для документирования происхождения SARS-CoV-2 и их распространения.
«В Omicron есть две линии, BA.1 и BA.2, которые довольно сильно различаются генетически, — сказал The Guardian Франсуа Баллу, директор Института генетики Университетского колледжа Лондона. — Эти две линии могут вести себя по-разному».
ПЦР-тесты сканируют несколько генов коронавируса, в том числе этот ген белка шипа, но варианты с 69-70del не будут давать положительный результат на шип. Вместо этого они заставляют тест ПЦР отображать ошибку, которая читается как «Сбой мишени S-гена». Эта особенность фактически позволяет легче обнаружить варианты с 69-70del, а именно омикрон и альфа, при ПЦР. После выявления таких случаев ученые затем проводят полный геномный анализ образцов, чтобы подтвердить, какой вариант вызвал данную инфекцию.
«Исключение S-гена имело решающее значение для быстрого обзора во многих различных частях Южной Африки и, таким образом, для отслеживания распространения подлинии BA.1″, — отмечает Сара Отто, профессор эволюционной биологии в Университете Британской Колумбии.
Но BA.2 не несет мутации 69-70del, а это означает, что он не будет отличаться от других вариантов при стандартных тестах ПЦР, и ученым, возможно, придется приложить больше усилий, чтобы найти его.
Хотя между двумя подлиниями омикрона есть ряд различий, нет никаких непосредственных оснований полагать, что одна будет вести себя иначе, чем другая, сказал Financial Times Дэвид Стюарт, профессор структурной биологии Оксфордского университета.
09.12.2021
Елена Краснова
Нет комментариев